Software gratuit care reunește date oceanice, de la adâncimile fundului mării la activitatea de pescuit
Pentru cercetătorii care studiază oceanul, găsirea datelor potrivite poate fi uneori la fel de dificilă precum analiza lor. Informațiile despre adâncimea fundului mării, locația munților submarini sau temperatura suprafeței mării există, însă reunirea lor din surse diferite și pregătirea în formatul necesar poate consuma mult timp și efort de programare.
O echipă de cercetători, inclusiv oameni de știință de la Universitatea din California, Santa Barbara, a dezvoltat un instrument menit să simplifice acest proces, astfel încât specialiștii să se poată concentra pe întrebările de cercetare în loc să petreacă timp curățând date. Pachetul software, numit oceandatr, a fost creat în R, un limbaj de programare larg utilizat pentru analiza datelor. Cu o singură comandă, utilizatorii pot accesa și organiza o gamă largă de seturi globale de date oceanice și le pot pregăti pentru analiză și cartografiere. Echipa descrie noul pachet într-un articol publicat în revista Ecology and Evolution.
Potrivit autorului principal, Jason Flower, cercetător în cadrul Laboratorului de Piețe de Mediu (emLab) al universității, cel mai important aspect este că instrumentul îi poate ajuta pe toți cei care au nevoie de date geospațiale oceanice să obțină rapid și ușor informațiile necesare, în formatul dorit. Flower și colegii săi au dezvoltat oceandatr, în parte, prin colaborarea cu Institutul Waitt pentru planificarea spațială marină în state insulare mici precum Vanuatu și Fiji.
Date oceanice mai accesibile
Planificarea viitorului oceanului necesită date despre hărțile fundului mării, temperatură și activități umane precum pescuitul. Cercetătorii trebuie adesea să adune aceste informații din multiple surse și să scrie cod nou pentru a combina seturile de date. Echipa a creat oceandatr pentru a simplifica acest proces: în loc să rescrie în mod repetat aceleași scripturi, cercetătorii le-au transformat în funcții gata de utilizare în cadrul pachetului. Software-ul, găzduit pe GitHub, este disponibil gratuit oricărui cercetător.
„Acest articol este unic prin faptul că nu am încercat să răspundem unei întrebări de cercetare specifice”, a declarat coautoarea Echelle Burns, cercetătoare la emLab. „Am construit un instrument pentru oamenii de știință marini ca noi, care ajung să folosească aceleași fluxuri de extragere și organizare a datelor iar și iar.”
De la adâncimea fundului mării la activitatea de pescuit
Pachetul poate recupera o varietate de seturi de date spațiale oceanice, inclusiv informații despre adâncimea fundului mării, locația munților submarini și temperatura suprafeței mării. În articol, cercetătorii demonstrează două aplicații posibile: utilizarea datelor oceanice pentru a ghida planificarea ariilor marine protejate și modelarea și cartografierea zonelor în care activitatea de pescuit este probabil să aibă loc. Aceste exemple reprezintă doar o parte din ceea ce poate face instrumentul.
„Pachetul poate fi folosit în orice proiect de știință marină care necesită date spațiale”, a spus Flower. O caracteristică deosebit de utilă este capacitatea de a standardiza date din surse diferite. Cercetătorii trebuie adesea să combine mai multe seturi de date, dar acestea pot fi stocate în formate sau la scări spațiale diferite. De exemplu, datele batimetrice pe care le extrage oceandatr au o rezoluție de 15 secunde de arc (aproximativ 0,004 grade), în timp ce datele privind efortul de pescuit sunt mai grosiere, la 0,01 grade. Pachetul ajută la aducerea lor într-un format consistent, astfel încât utilizatorii să se poată concentra asupra analizei.
Instrumentul accesează seturi globale de date, dar poate fi util și pentru cercetătorii care lucrează în zone relativ mici, inclusiv insule individuale sau regiuni de coastă. „Utilizatorii își pot furniza propriile seturi de date, iar oceandatr se va asigura că acestea sunt salvate la scara spațială adecvată”, a explicat Burns.
Un instrument în continuă evoluție
Cercetătorii intenționează să continue extinderea și îmbunătățirea pachetului oceandatr. Adăugirile viitoare ar putea include date zilnice privind temperatura suprafeței mării, alături de informațiile medii deja disponibile. Flower lucrează de asemenea la creșterea vitezei și eficienței software-ului, astfel încât acesta să rămână accesibil pentru cercetătorii care folosesc calculatoare mai vechi sau mai lente.
Ca multe instrumente software științifice, oceandatr nu este conceput ca un produs finit. „Pachetele R evoluează constant, iar oceandatr va evolua odată cu ele”, a spus Burns. „Este un pachet «viu» care va continua să fie actualizat și rafinat în anii următori.” Cercetătorii speră că, prin eliminarea unei părți din munca repetitivă de găsire și pregătire a datelor, oceandatr le va oferi oamenilor de știință mai mult timp pentru a se concentra asupra întrebărilor la care datele pot ajuta să răspundă.
