Un ecosistem comun de date ar putea ajuta cercetătorii să descopere noi conexiuni biologice
Cercetătorii generează cantități uriașe de date științifice, însă conectarea informațiilor între diferite studii rămâne o provocare. NIH Common Fund Data Ecosystem își propune să schimbe această situație, făcând seturile de date din 18 programe ale NIH mai ușor de găsit, de conectat și de analizat.
Inițiativa reunește resurse de cercetare din domenii precum genetica umană, microbiomele și tehnologiile emergente, oferindu-le oamenilor de știință posibilitatea de a explora relații care altfel ar rămâne ascunse în studii separate. Un articol nou publicat în revista Patterns descrie dezvoltarea ecosistemului, infrastructura și instrumentele sale, precum și eforturile de evaluare a impactului.
„Provocarea nu mai este doar generarea de date științifice suplimentare. Este vorba despre a face datele pe care le avem deja să funcționeze împreună în moduri care să îi ajute pe cercetători să răspundă la întrebări pe care nu le puteau aborda anterior”, a declarat Casey Greene, profesor de informatică biomedicală la CU Anschutz și autor principal al studiului. „Atunci când informațiile sunt conectate între programe de cercetare, oamenii de știință au mai multe oportunități de a identifica tipare, de a explora relații noi și de a construi pe descoperirile altora.”
Scopul este ca seturile complexe de date să fie mai ușor de găsit, de interpretat și de analizat, inclusiv pentru cercetătorii fără competențe avansate de programare sau bioinformatică. Înțelegerea unei boli sau identificarea unei ținte terapeutice promițătoare poate cere conectarea informațiilor genetice cu măsurători moleculare, date despre țesuturi și rezultate din experimente de screening al medicamentelor.
„Descoperirea științifică rareori are loc în izolare. Un rezultat dintr-un set de date poate deveni mult mai semnificativ atunci când este examinat alături de dovezi din alt studiu sau din alt domeniu al biologiei”, a spus Julie A. Jurgens, director asociat pentru livrare științifică în cadrul Knowledge Portal Network al Broad Institute of MIT and Harvard și autor corespondent al studiului. „Construirea conexiunilor între aceste resurse îi poate ajuta pe cercetători să petreacă mai puțin timp navigând prin sisteme fragmentate și mai mult timp punând întrebări științifice importante.”
Cercetătorii de la CU Anschutz contribuie la coordonarea și evaluarea inițiativei, ajutând la aprecierea modului în care infrastructura comună de cercetare sprijină oamenii de știință și aduce valoare între programele de cercetare. Echipa analizează dacă legarea seturilor de date între programe îi ajută pe cercetători să găsească și să folosească informațiile într-un mod în care depozitele publice separate nu o pot face.
Specialiștii evaluează și indicatori ai implicării și impactului cercetării, inclusiv cât de des folosesc oamenii de știință resursele online ale ecosistemului și citează publicațiile aferente. Rezultatele preliminare sugerează că publicațiile de cercetare conexe ar putea primi mai multe citări decât lucrări comparabile, deși este nevoie de analize suplimentare pentru a înțelege semnificația acestor diferențe.
Pe măsură ce inteligența artificială devine mai proeminentă în cercetarea științifică, seturile de date bine organizate și conectate ar putea ajuta și instrumentele computaționale să analizeze mai eficient informațiile științifice. „Oportunitatea pe termen lung este de a crea un mediu de cercetare în care datele valoroase să nu stea în depozite separate, așteptând ca cineva să facă conexiunea potrivită”, a declarat Sean Davis, profesor de bioinformatică la CU Anschutz. „Făcând aceste conexiuni mai ușor de descoperit și de explorat, îi putem ajuta pe oamenii de știință să obțină mai multă valoare din cercetarea existentă și să creeze noi oportunități pentru descoperiri viitoare.”
