Studiu: Noi caracteristici structurale ale subliniei SARS-CoV-2 RE.2.2
Cercetători de la Institutul de Microbiologie al Academiei Chineze de Științe au analizat proprietățile structurale și funcționale ale subliniei emergente SARS-CoV-2 BA.3.2.2, prin studierea liniei RE.2.2, ramura care câștigă prevalență în Europa după o perioadă îndelungată de detectare redusă în datele de supraveghere.
Studiul, publicat în revista Proceedings of the National Academy of Sciences, a fost realizat de laboratorul profesorului Gao George Fu. Cercetătorii au descoperit că RE.2.2 prezintă o legare îmbunătățită la receptorul uman ACE2, un profil distinct de evaziune la anticorpi și un loc de glicozilare N-legată la reziduul N529 al proteinei spike, o caracteristică nemaîntâlnită anterior.
Afinatate crescută pentru receptorul uman ACE2
Folosind rezonanța plasmonului de suprafață și microscopia crioelectronică, cercetătorii au determinat că domeniul de legare a receptorului al RE.2.2 prezintă o afinitate ridicată pentru enzima de conversie a angiotensinei 2 umane.
Analizele structurale au arătat că o mutație reversă, R493Q, formează o legătură de hidrogen suplimentară cu reziduul K31 al receptorului uman, acționând ca determinant principal al interacțiunii crescute cu receptorul.
De asemenea, cercetătorii au testat interacțiunea RE.2.2 cu proteine ACE2 din diferite specii animale. Rezultatele au indicat că spectrul de specii gazdă este comparabil cu cel al variantelor omicron folosite pentru comparație.
Evaziune la anticorpi cu anumite compromisuri
Testele de neutralizare a pseudovirusurilor și analizele de legare au demonstrat un peisaj remodelat de evaziune imună. Deși RE.2.2 a evitat multiple clase de anticorpi, mai mulți anticorpi cu neutralizare largă care își pierduseră activitatea împotriva liniilor omicron anterioare, precum S2K146 și L4.65, au recăpătat capacitate puternică de neutralizare împotriva RE.2.2.
Structurile ternare obținute prin criomicroscopie electronică au arătat că substituția cheie G446D facilitează direct interacțiunile cu anticorpii, ilustrând faptul că evoluția antigenică virală este constrânsă de cerințe structurale.
Un loc de glicozilare nou identificat
Profilarea glicoproteomică cuprinzătoare, folosind cromatografia de lichide cuplată cu spectrometrie de masă în tandem și criomicroscopia electronică, a relevat până la 26 de locuri de glicozilare N-legată pe trimerul proteinei spike.
Printre acestea, RE.2.2 prezintă un loc nou de glicozilare N-legată la poziția N529 de pe domeniul de legare a receptorului, o modificare nemaîntâlnită până acum la variantele SARS-CoV-2. Această modificare formează legături de hidrogen inter-protomerice care stabilizează structural proteina spike într-o conformație închisă, echilibrând afinitatea ridicată pentru receptor cu intrarea virală reglată.
Rezultatele susțin și regula „O-follows-N” a glicozilării proteinelor, evidențiind organizarea coordonată a glicanilor în proteinele spike ale coronavirusurilor.
